作為推動新千年基礎科學研究的重要戰略步驟和作為知識創新工程中的一個試點，中國科學院于 1999 年 11 月 27 日成立了神經科學研究所。神經科學研究所將致力于神經科學基礎研究的各個領域，包括分子、細胞和發育神經生物學、系統和計算神經科學、以及認知和行為神經科學。研究所的宗旨是建立一個現代化研究所的機制，提供一個有助于嚴謹科研工作，高效科研產出，良性科研合作的環境，實現以業績為準的激勵和資助評估系統，以及為研究生和博士后提供高質量的專業訓練。
